Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPLO60437 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPLO60437 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPLO60437 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PPLO60437 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPLO60437 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPLO60437 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPLO60437 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPLO60437 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPLO60437 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPLO60437 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPLO60437 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPLO60437 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPLO60437 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPLO60437 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPLO60437 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPLO60437 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPLO60437 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPLO60437 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPLO60437 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPLO60437 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PPLO60437 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPLO60437 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPLO60437 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPLO60437 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPLO60437 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPLO60437 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPLO60437 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPLO60437 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPLO60437 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPLO60437 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPLO60437 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPLO60437 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPLO60437 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPLO60437 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPLO60437 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPLO60437 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPLO60437 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPLO60437 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPLO60437 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PPLO60437 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPLO60437 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPLO60437 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PPLO60437 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPLO60437 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPLO60437 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPLO60437 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPLO60437 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPLO60437 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPLO60437 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPLO60437 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPLO60437 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPLO60437 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPLO60437 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPLO60437 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPLO60437 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPLO60437 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPLO60437 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPLO60437 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPLO60437 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PPLO60437 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PPLO60437 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPLO60437 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPLO60437 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPLO60437 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPLO60437 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPLO60437 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPLO60437 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPLO60437 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPLO60437 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPLO60437 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPLO60437 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPLO60437 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPLO60437 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPLO60437 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPLO60437 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPLO60437 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPLO60437 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPLO60437 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPLO60437 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPLO60437 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PPLO60437 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPLO60437 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PPLO60437 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPLO60437 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPLO60437 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPLO60437 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPLO60437 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPLO60437 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPLO60437 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPLO60437 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPLO60437 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPLO60437 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPLO60437 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPLO60437 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPLO60437 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPLO60437 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPLO60437 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PPLO60437 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPLO60437 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms