Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPAG9O60271 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPAG9O60271 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms