Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKNO60260 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKNO60260 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKNO60260 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKNO60260 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKNO60260 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKNO60260 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKNO60260 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKNO60260 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKNO60260 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKNO60260 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRKNO60260 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRKNO60260 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRKNO60260 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKNO60260 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKNO60260 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKNO60260 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKNO60260 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKNO60260 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKNO60260 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKNO60260 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKNO60260 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKNO60260 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKNO60260 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKNO60260 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKNO60260 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKNO60260 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKNO60260 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKNO60260 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKNO60260 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKNO60260 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKNO60260 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKNO60260 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKNO60260 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKNO60260 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRKNO60260 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms