Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL13O43927 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms