Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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PDE6DO43924 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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PDE6DO43924 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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PDE6DO43924 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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PDE6DO43924 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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PDE6DO43924 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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PDE6DO43924 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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PDE6DO43924 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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PDE6DO43924 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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PDE6DO43924 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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PDE6DO43924 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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PDE6DO43924 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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PDE6DO43924 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDE6DO43924 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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