Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB3O43889 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB3O43889 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB3O43889 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB3O43889 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB3O43889 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB3O43889 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB3O43889 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB3O43889 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB3O43889 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB3O43889 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB3O43889 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREB3O43889 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREB3O43889 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREB3O43889 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CREB3O43889 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREB3O43889 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREB3O43889 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREB3O43889 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREB3O43889 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREB3O43889 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREB3O43889 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREB3O43889 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREB3O43889 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms