Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPRY3O43610 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPRY3O43610 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPRY3O43610 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPRY3O43610 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPRY3O43610 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPRY3O43610 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPRY3O43610 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPRY3O43610 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPRY3O43610 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPRY3O43610 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SPRY3O43610 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPRY3O43610 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPRY3O43610 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPRY3O43610 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPRY3O43610 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPRY3O43610 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPRY3O43610 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPRY3O43610 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPRY3O43610 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPRY3O43610 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPRY3O43610 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPRY3O43610 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPRY3O43610 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPRY3O43610 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPRY3O43610 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPRY3O43610 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPRY3O43610 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPRY3O43610 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPRY3O43610 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPRY3O43610 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPRY3O43610 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPRY3O43610 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPRY3O43610 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPRY3O43610 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPRY3O43610 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPRY3O43610 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SPRY3O43610 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms