Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNQ2O43526 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms