Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

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Length 1,280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF208O43345 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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ZNF208O43345 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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ZNF208O43345 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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ZNF208O43345 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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ZNF208O43345 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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ZNF208O43345 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF208O43345 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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