Protein–RNA interactions for Protein: O15315

RAD51B, DNA repair protein RAD51 homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51BO15315 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAD51BO15315 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms