Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVH48-1M5A8F1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVH48-1M5A8F1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVH48-1M5A8F1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVH48-1M5A8F1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVH48-1M5A8F1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVH48-1M5A8F1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVH48-1M5A8F1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVH48-1M5A8F1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVH48-1M5A8F1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVH48-1M5A8F1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVH48-1M5A8F1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVH48-1M5A8F1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVH48-1M5A8F1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVH48-1M5A8F1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVH48-1M5A8F1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVH48-1M5A8F1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVH48-1M5A8F1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVH48-1M5A8F1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVH48-1M5A8F1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVH48-1M5A8F1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms