Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN34H7C241 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms