Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

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Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM5B3KS81 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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