Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A8MVJ9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A8MVJ9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
A8MVJ9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A8MVJ9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A8MVJ9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A8MVJ9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A8MVJ9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
A8MVJ9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A8MVJ9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A8MVJ9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A8MVJ9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
A8MVJ9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
A8MVJ9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
A8MVJ9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
A8MVJ9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
A8MVJ9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
A8MVJ9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A8MVJ9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A8MVJ9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
A8MVJ9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A8MVJ9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A8MVJ9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A8MVJ9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A8MVJ9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A8MVJ9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A8MVJ9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A8MVJ9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A8MVJ9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A8MVJ9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A8MVJ9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A8MVJ9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
A8MVJ9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A8MVJ9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A8MVJ9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A8MVJ9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A8MVJ9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A8MVJ9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A8MVJ9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A8MVJ9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A8MVJ9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A8MVJ9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A8MVJ9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A8MVJ9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A8MVJ9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A8MVJ9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A8MVJ9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A8MVJ9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A8MVJ9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A8MVJ9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A8MVJ9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
A8MVJ9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
A8MVJ9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
A8MVJ9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A8MVJ9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
A8MVJ9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A8MVJ9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A8MVJ9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A8MVJ9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
A8MVJ9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms