Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RGPD3A6NKT7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RGPD3A6NKT7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms