Protein–RNA interactions for Protein: A6NHL2

TUBAL3, Tubulin alpha chain-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBAL3A6NHL2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TUBAL3A6NHL2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TUBAL3A6NHL2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms