Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AUP1Q9Y679 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms