Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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SNX13Q9Y5W8 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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SNX13Q9Y5W8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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SNX13Q9Y5W8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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SNX13Q9Y5W8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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SNX13Q9Y5W8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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SNX13Q9Y5W8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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