Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP16Q9Y5T5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms