Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRAF6Q9Y4K3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF6Q9Y4K3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms