Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms