Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HIF3AQ9Y2N7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms