Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms