Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX12Q9UMY4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms