Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PALD1Q9ULE6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms