Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms