Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FOXD3Q9UJU5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms