Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CHORDC1Q9UHD1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms