Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DKK4Q9UBT3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms