Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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SH3BP4Q9P0V3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SH3BP4Q9P0V3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SH3BP4Q9P0V3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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SH3BP4Q9P0V3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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SH3BP4Q9P0V3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SH3BP4Q9P0V3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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SH3BP4Q9P0V3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SH3BP4Q9P0V3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4Q9P0V3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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