Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HACD3Q9P035 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HACD3Q9P035 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms