Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TVP23BQ9NYZ1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms