Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOXC10Q9NYD6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms