Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CWC25Q9NXE8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CWC25Q9NXE8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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