Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NLE1Q9NVX2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NLE1Q9NVX2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms