Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms