Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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LTBP3Q9NS15 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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LTBP3Q9NS15 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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LTBP3Q9NS15 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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LTBP3Q9NS15 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
LTBP3Q9NS15 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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LTBP3Q9NS15 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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LTBP3Q9NS15 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LTBP3Q9NS15 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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LTBP3Q9NS15 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LTBP3Q9NS15 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LTBP3Q9NS15 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LTBP3Q9NS15 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBP3Q9NS15 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBP3Q9NS15 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBP3Q9NS15 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBP3Q9NS15 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBP3Q9NS15 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBP3Q9NS15 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBP3Q9NS15 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBP3Q9NS15 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBP3Q9NS15 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LTBP3Q9NS15 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
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