Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms