Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLE3Q9NRF9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms