Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
APOBEC3GQ9HC16 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
APOBEC3GQ9HC16 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms