Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM38AQ9H6F2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms