Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GFRA4Q9GZZ7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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