Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCL11BQ9C0K0 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms