Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D4

ZNF518B, Zinc finger protein 518B, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF518BQ9C0D4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF518BQ9C0D4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF518BQ9C0D4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF518BQ9C0D4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF518BQ9C0D4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms