Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B6

BRINP2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP2Q9C0B6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BRINP2Q9C0B6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms