Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms