Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
KRTAP2-4Q9BYR9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms