Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
PCGF6Q9BYE7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCGF6Q9BYE7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms