Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF17Q9BXT8 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms