Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HIRIP3Q9BW71 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HIRIP3Q9BW71 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms